A prenatalis ultrahang-szűrővizsgálatok hatékonyságát különböző tanulmányok széles tartományban, 18-85% között határozzák meg A magzati malformációk szűrésében elért eredményeket olyan külső tényezők befolyásolják, mint az ultrahang-szűrővizsgálatok száma, időpontja, módja, technikai feltételei és a vizsgálók tapasztalata. A központi idegrendszer, vese és vizeletelvezető rendszer rendellenességeit sikerül legnagyobb arányban prenatalisan diagnosztizálni, míg a vitiumok a leggyakrabban fel nem ismert malformációk közé tartoznak. Biokémiai és ultrahang-szűrőmódszerek kombinálásával kiemelhetők a kromoszóma rendellenességekre nézve magas rizikójú terhességek, ahol javasolt a magzat kariotípusának meghatározása. A magzati anatómián túl olyan eltérésekre is figyelni kell, mint a magzatvíz mennyiségi változásai, a magzat növekedési zavara, a köldökzsinór szerkezete, és a koraterhességben észlelt nuchalis ödéma vagy cisztikus hygroma, amelyek felhívhatják a vizsgáló figyelmét magzati fejlődési rendellenesség jelenlétének fokozott kockázatára.