Az emlőrák kialakulásában fontos szerepet játszanak a driver gének és az aktivált jelpályák. Napjainkban előtérbe került az aktivált, mutáns jelpályák közötti párbeszéd jelentősége a carcinogenesisben. Az emlőrák keletkezésében a Notch jelvivő utat tekintik a "fő bűnösnek", és úgy gondolják, hogy az ún. "bűnös tengely" szereplői még a HER2 és a rákőssejtek. Minden arra utal, hogy ezt a tengelyt kiegészíti az epithelialis-mesenchymalis transitio (EMT), amely az őssejtek működését szabályozó fejlődési jelpályákkal együtt alakítja ki és tartja fenn a rákőssejtekre jellemző tulajdonságokat. Az EMT fontos szerepet játszik az ép szövetekben már a korai embrionális fejlődésben, később pedig a rák patogenezisében. A rák genetikai, epigenetikai és őssejtbetegség, de a malignus folyamat kialakulását a szervspecifikus mikrokörnyezet is jelentősen segíti. Az epigenetikai és mikrokörnyezeti tényezők carcinogenetikai szerepét korábban már összefoglaltuk.