Jelen közleményünkben a pajzsmirigyhormonok (tiroxin, liotironin, reverz liotironin) és előanyagaik (tirozin, monojódtirozin, dijódtirozin) részecske-specifikus bázicitásának és lipofilitásának meghatározását és az e paraméterekből levonható biológiai következtetéseket foglaljuk össze, főként saját vizsgálataink alapján. A vegyületek protonálódási makroállandóit 1H NMR-pH titrálással, míg a mikroállandókat csökkentett számú protonálható csoporttal rendelkező származékvegyületek felhasználásával, kombinált spektroszkópiai-deduktív módszerrel határoztuk meg. A kapott mikroállandók azt mutatták, hogy az eltérő számú és/vagy helyzetű jódatom a molekulákban legnagyobb mértékben a fenolát bázicitását befolyásolja. A fenolátcsoport eltérő ionizációs állapotai jelentős szerepet játszanak a pajzsmirigyhormonok bioszintézisében és fehérjékhez való kötődésében. A báziscentrumok protonálódási állapotának szerepét a receptorkötődésben in silico dokkolással tisztáztuk. A pajzsmirigyhormonok összes mikrorészecskéit a pajzsmirigyhormon-receptor két izoformájához dokkoltuk. Eredményeink azt mutatták, hogy a ligand és a receptor közötti kölcsönhatás kialakításában az aminosav oldallánc protonáltsági állapota meghatározó. Megállapítható továbbá, hogy nem az a részecske rendelkezik a legerősebb kötődési képességgel, mely a vér pH-ján legnagyobb koncentrációban fordul elő. Az egyes mikrorészecskék lipofilitását karboximetil- és O-metilszármazékvegyületek felhasználásával, különböző pH-kon mért megoszlási hányadosok meghatározásával végeztük. A kémiai módosítás hatását korrekciós faktor bevezetésével vettük figyelem-be. Eredményeink szerint a pajzsmirigyhormonok lipofilitásának kialakításában a döntő szerkezeti elem a jódozott aromás gyűrű-rendszer, az alifás rész protonálódása csekély hatást gyakorol a megoszlási hányadosokra. A részecske-specifikus lipofilitásokkal a vegyületek membrántranszportja molekuláris szinten magyarázható. Fiziológiás pH-n a pajzsmirigyhormonok amfifil tulajdonságúak a lipofil aromás gyűrű és a hidrofil aminosav oldallánc miatt, ami azt eredményezi, hogy a molekulák csak szállítófehérje segítségével képesek átjutni a membránokon. A vegyületek részecske-specifikus fizikai-kémiai állandóinak ismerete szükséges a pajzsmirigyhormonok (pato)fiziológiás viselkedésének molekuláris szintű megértéséhez és gyógyászati befolyásoláshoz.