A béltraktus mikrobáinak, a mikrobiótának és genetikai jellemzésüknek, a mikrobiomnak a kutatása egyre erőteljesebben jelentkezik az orvostudomány területén. Nehézséget jelent, hogy a mikroorganizmusok nagy része nem tenyészthető, csak genomjaik jelzik jelenlétüket és teszik lehetővé azonosításukat. Az eddigi eredmények, amelyek e hatalmas területnek még csak kis részét mutatják be, utalnak a mikrobióta és gastrointestinalis rendszer működésének és egyes kórfolyamatainak összefüggésére, sőt arra is, hogy a bél-barrier zavara extraintestinalis, metabolikus és immunrendszer közvetítette betegségek kockázatát is növeli. Mindezek az új ismeretek nemcsak a prevenciós, hanem a terápiás beavatkozások hatékonyságát növelhetik.