Az alapkutatás eredményeire épült alkalmazott gyakorlati, klasszikus bakteriológiai és molekulárgenetikai módszerek modelljének tekinthetjük a bakteriofágok felfedezéséből kiinduló fágtípusmeghatározási módszereket, melyeket részben nemzetközi együttműködés alapján részben osztályunkon dolgoztunk ki. A molekuláris genetikai kutatások eredményei alapján sikerült a hazai járványügyi helyzetnek megfelelően a klasszikus és molekuláris genetikai módszereket bevezetni. Példákon mutatjuk be a területi és nozokomiális fertőzéseket okozó baktériumok tipizálási eredményeit, javaslatokat téve számos feno- és genotipizálási módszer alkalmazására. Legújabb munkáinkkal a fokozott virulenciájú klónok kimutatásával, a Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Salmonella enterica serotype Typhimurium (S. Typhimurium) és a methicillin rezisztens Staphylococcus aureus (MRSA) törzsek esetén hozzájárultunk a világszerte végzett molekuláris epidemiológiai eredményekhez.