A tüdőtranszplantáltak életkilátásait jelentősen befolyásolja az infekciók és rejekciók időben történő felismerése és megfelelő kezelése. Légzésfunkciós romlás esetén mindig törekedni kell a konkrét kórok meghatározására bronchoscopia segítségével. Az alkalmazott immunszuppresszív kezelés következtében azonban gyakran tünetmentesen zajlanak az infekciók és rejekciók. Ha ezek kezelés nélkül maradnak, jelentősen megemelkedik a krónikus rejekció valószínűsége, ami rontja az életminőséget és csökkenti a túlélést. Mindez megerősíti a látszólag teljesen jó állapotú betegeknél is a gondozási protokollban meghatározott kontroll bronchoscopiák elvégzésének fontosságát.