Az autoimmun betegségek patogenezise komplex folyamat, melyben provokáló tényezők, autoantigének, genetikai fogékonyság és immunológiai szabályozó tényezők interakciói vesznek részt. A potenciális környezeti tényezők közül a vírusok szerepe a legfontosabb. A mikrobiális antigének olyan "keresztreagáló" immunválaszt váltanak ki, mely képes a saját antigénekkel reagálni, így az infekciók nem specifikus úton fokozzák a saját antigének bemutatását az immunrendszer számára. Az immunszisztéma a "fail-safe" mechanizmussal gátolja a fertőzéshez társult szöveti károsodást és így gátolja az autoimmun választ. Az autoimmun betegségek és a fertőzések közötti kapcsolat alapján merül fel az a kérdés, hogy a vakcinák is képesek-e autoimmun jelenségeket, autoimmun betegségeket provokálni. A közleményben bemutatjuk azokat a mechanizmusokat, melyek az autoimmunitás indukálásában szerepet játszanak. Az autoimmun betegségekben fokozott a fertőzésekre való fogékonyság, melynek két fontos tényezője van. Az egyik az immunválasz intrinsic zavara, a másik az alkalmazott immunszuppresszív kezelés, ami nagyon fontos a betegségek aktivitásának kontrollálásában. Az autoimmun betegeken kialakuló fertőzések néhány speciális kérdését is tárgyaljuk.