A súlyos gombafertőzések előfordulási gyakorisága és megjelenési formája növekszik. Az immunsuppresszált személyek általában sokkal esendőbbek a nem szokványos, gyakran a környezetben természetes körülmények között is előforduló gombafertőzésekre is. A klinikai tünetek a kolonizációtól, a krónikus lokalizált fertőzéseken keresztül, a súlyos invazív fertőzésekig jelentkezhetnek. Amikor ezek jelen vannak gyakran sikerül izolálni a ritka, vagy a korábban ismert, és jelenleg egyre emelkedő előfordulási gyakoriságot mutató gombákat. Ilyenkor szövettani vizsgálat is szükséges lehet a kolonizáció vagy invazív fertőzés elkülönítéséhez. Nincs egyértelmű szerológiai diagnosztika és a radiológiai eltérések sem specifikusak a gombafertőzésekre. Ugyanakkor az újabban izolált gombákon vitro rezisztenciát mutathatnak a régebbi azol származékokkal és az amphotericin B-vel szemben. Éppen ezért néha a sikeres kezeléshez az érintett terület sebészeti góctalanítása, valamint az immunrendszer helyreállítása is szükséges. Az újabb azolok és echinocandinok hatásos fegyverek lehetnek az ilyen gombafertőzések elleni küzdelemben.