A pajzsmirigyműködés terhességben élettani körülmények között is megváltozik, az első trimeszterben ún. fiziológiás hyperthyreosis alakul ki (a TSH-érték csökken). A terhesség alatt az autoimmun pajzsmirigybetegségek spontán remissziója figyelhető meg, de a szülés után ezek kiújulása jelenthet diagnosztikus és terápiás gondot. A szüléseket követően gyakran jelentkező posztpartum thyreoiditisben és a spontán vetélések egy részének létrejöttében a pajzsmirigy peroxidáz enzim elleni antitesteknek, Basedow-Graves-kórban pedig a TSH-receptor elleni antitesteknek van klinikai jelentősége. Mind a hyper- mind a hypothyreosis fontos a fertilitási zavarok kialakulásában. A jódhiány megszüntetése a terhesség alatt (250-300 umg/nap jód bevitelével) feltétlenül ajánlatos - kivételt csak az autoimmun pajzsmirigybetegségek képeznek.