Az infektológia imponáló fejlődése mellett számos új kihívással kell szembenéznünk, ami jelentős részben a kórokozó spektrum változásának tudható be. Az antimikróbás terápia fejlődésének köszönhetően mára már képesek lehetünk gyógyszereink racionális alkalmazására, mellyel jobb klinikai eredményeket érhetünk el kisebb rezisztencia indukcióval. Emellett szükség van a rezisztens kórokozók terjedésének megfékezésére, különös tekintettel arra, hogy új antibiotikum megjelenése a közeljövőben nem várható. Az igazi kihívás a magyar orvostársadalom részére annak realizálása, hogy az infektológiai szaktudás felhasználása nélkül egyre nehezebb lesz és egyre magasabb költséggel jár a növekvő számú rezisztens kórokozók által okozott infekciós kórképek ellátása.