Célunk a Ciphergen ProteinChip technológia alkalmasságának, mint a proteomika eszközének tesztelése az endometriózis kutatásban. A vizsgálatban 3 enyhe endometriózisos és három nem endometriózisos, kontrollként szereplő szekretorikus fázisban (20-22 nap) lévő beteg vett részt. Az endometriózisos betegekből 3 endometrium, 3 nem érintett peritoneum és 3 peritoneális endometriózis lézió mintát vettünk, míg a kontroll csoporthól 3 endometrium-szövetet használtunk. A vizsgálat a 2,8-12,3 kDa tartományban jelentősen; 1/3-1/24-szeresen alacsonyabb fehérjeexpressziós szintet mutatott endometriózis endometriumban, mint a kontroll csoport endometriumaiban. A nem érintett peritoneummal összehasonlítva, az endometriózis léziók emelkedett fehérjeszintet mutattak a 3-96 kDa tartományban. Különösen emelkedett volt a 22-23 kDa közötti fehérje szintje, mely azonosítás után transgelinnek bizonyult, amely egy aktinkötő simaizom-fehérje.