Az elmúlt évtizedekben a humán mikrobiom kutatása exponenciális növekedést mutat és számos betegség kialakulásával hozták kapcsolatba. A bennünk élő baktériumok vizsgálata már Louis Pasteur korára nyúlik vissza, melyet jelenleg a világon a Humán Mikrobiom Project vállalt magára, mivel a mikrobiomunk a második humán genom. A cikkben részletezzük, hogy milyen fontos szerepe van a bélflóránknak és annak sérülése, milyen káros változásokat indít be szervezetünkben. Az antibiotikumok felfedezése a 20. század legnagyobb vívmánya volt, de helytelen alkalmazása óriási gazdasági és egészségügyi károkat okoz, beleértve az antibiotikum-rezisztens baktérium törzsek elszaporodását. Az antibiotikum használatának hosszú távú hatásai a különböző betegségek halmozódásában figyelhetők meg. Részletezzük még, hogy mely gyógyszereknek van még károsító szerepe a mikrobiomra. Megoldást kínálunk a megváltozott mikrobiom helyreállítására különböző módszerekkel és felvetítjük, hogy milyen antibiotikum helyettesítő terápiák léteznek. Ne felejtsük el, ahogyan a gyógyszerek hatnak a bélbaktériumokra, a bélbaktériumok is befolyásolják a gyógyszerek enzimatikus lebomlását, biohasznosulását, aktivációját vagy toxicitását. Tehát a gyógyszerek és a mikrobiom kapcsolata kétirányú.  Kulcsszavak: humán mikrobiom, antibiotikum, dysbiosis, probiotikum, prebiotikum, széklet transzplantáció