A Nemzetközi Probiotikum és Prebiotikum Tudományos Társaság (International Scientific Association of Probiotics and Prebiotics, ISAPP) definíciója szerint a probiotikumok olyan élő mikroorganizmusok, amelyek adekvát mennyiségben adva a szervezet számára egészségi előnyt jelentenek. A probiotikumok legtöbbször baktériumok, amelyek közül leginkább használatosak a lactobacillusok és a bifidobaktériumok, de lehet gomba is, mint a Saccharomyces boulardii. Nem helyes általában probiotikumokról beszélni, hanem mindig egy konkrét probiotikum vagy több ismert probiotikum együttes hatását kell meghatározni egy adott kórkép kezelésében vagy megelőzésében.