Három gyakori, az immunrendszer működését befolyásoló emésztőszervi kórképben tekintjük át a SARS-CoV-2 vírus elleni vakcinációs ismereteket. A cöliákiában a gluténmentes diéta tartása minden időben fontos, de az immunstátuszt elsősorban a hyposplenia határozza meg, ezekben az esetekben különösen fontos a védőoltás. A hazánkban sok embert érintő májcirrózis egyértelműen immunszupprimált státuszt jelent. A már régóta, egyéb fertőző betegségek megelőzése céljából alkalmazott védőoltások is csak a szokványostól eltérő dózisban és/vagy ritmusban alkalmazva hatékonyak májcirrózisban, ezért feltételezhető, hogy nem lesz ez másképpen a SARS-CoV-2 vírus elleni vakcinákkal sem. A gyulladásos bélbetegség gyakran gyenge immunműködéssel társul. Az anti-TNF infliximab alkalmazása esetében COVID-19 betegség után gyengébb védettség alakul ki, az oltási rendet pedig szigorúan be kell tartani, mert az első oltás után az ilyen kezelésben részesülő betegek kevésbé védettek.