Alsó légúti minták molekuláris mikrobiológiai vizsgálata a koronavírus-járvány időszakában / Károlyi Sándor [et al.]
Bibliogr.: p. 1302. - Abstr. hun., eng. - DOI: https://doi.org/10.1556/650.2022.32556
In: Orvosi Hetilap. - ISSN 0030-6002, eISSN 1788-6120. - 2022. 163. évf. 33. sz., p. 1295-1302. : ill.
Bevezetés: A BioFire FilmArray Pneumonia plus Panel (bioMérieux) az alsó légúti fertőzések mikrobiológiai diagnosztikájára kidolgozott "real-time" PCR-rendszer, mely 18 baktérium, 9 vírus és 7 antibiotikum-rezisztenciagén kimutatására képes. A két órán belül eredményt adó módszer segíti a pneumonia differenciáldiagnosztikáját, a terápiás döntéshozatalt. Célkitűzés: Laboratóriumunkban pneumonia kivizsgálása érdekében végzett PCR-paneltesztek eredményeinek áttekintése, a hagyományos bakteriológiai feldolgozás eredményeivel való összehasonlítása. Módszerek: A 2020. október és 2021. szeptember közötti időszakban 820, feltételezetten pneumoniás kórházi betegtől származó alsó légúti mintát vizsgáltunk a PCR-panellel. A mintákból a multiplex PCR-vizsgálat mellett tenyésztést is végeztünk. A kiegészítő SARS-CoV-2-PCR-vizsgálatok orr-garat törletből vett mintákból történtek. Eredmények: A minták 40%-a SARS-CoV-2-pozitív betegtől származott. A minták 60%-ánál jelzett patogént vagy rezisztenciagént a PCR-panel. A három leggyakrabban kimutatott kórokozó a Pseudomonas aeruginosa, a Staphylococcus aureus és az Acinetobacter baumannii volt. A PCR-rel detektált baktériumok 44%-a tenyésztéssel nem igazolódott, és viszont: tenyésztéssel számos olyan baktériumot, gombafajt, antibiotikum-rezisztenciamechanizmust igazoltunk, melyet a PCR-panel nem vizsgált, vagy melyre negatív eredményt adott. A SARS-CoV-2-pozitív csoportban a S. aureus adta az azonosított kórokozók 25,8%-át. A leggyakrabban kimutatott rezisztenciagén a mecA/C (MRSA) volt. A SARS-CoV-2-pozitív betegek mintáinak 2%-ában, míg a SARS-CoV-2-negatív betegek mintáinak 13%-ában mutattunk ki egyéb légúti vírusgént is. Következtetés: A kórházi pneumoniák gyakori kórokozóit PCR-vizsgálataink eredményei igazolták. A PCR-panel célspektrumában nem szereplő kórokozók jelentősége és az antibiotikumrezisztenciák multifaktoriális volta miatt a pneumoniaspecifikus multiplex PCR-vizsgálatokat tenyésztéssel együtt javasolt végezni, és ezek eredményét együttesen érdemes értelmezni. Kulcsszavak: BioFire, multiplex PCR, pneumonia