Tényként kezelhető, hogy az intesztinális mikrobiom eubiózisa vagy diszbiózisa - a gasztrointesztinális funkciók befolyásolásán kívül - hatással van a szervezet egészének a működésére. Ehhez igazodva a tudományos kutatások fókusza is áthelyeződőben van: a bélben élő egyes mikroorganizmusok katalógusszerü karakterizálása helyett egyre inkább az intesztinális mikrobiom egészének a gazdaszervezet egészségére/kórállapotaira kifejtett hatását vizsgálják.