Az akut gastroenteritis gyermekkorban rendszerint néhány nap alatt spontán, szövődmények nélkül gyógyul, a betegség lefolyását az életkor, testsúly, az etiológia és a kísérő betegségek fennállása határozza meg. Enyhe esetekben nincs szükség kezelésre, a cél a tünetek enyhítése és a dehidráció elkerülése, súlyos dehidráció esetén viszont kórházi ellátásra kerül sor. A kezelés legfontosabb eleme a rehidráció, amely történhet orálisan, nasogastricus szondán át vagy parenterálisan. Az etiológiára többnyire nem derül fény: a hasmenés döntően virális eredetű. Antibiotikum adása csak bizonyos esetekben indokolt (ilyenek például a salmonellosis egyes esetei, a Campylobacter-fertőzés, vagy a shigellosis). A prevenció legfontosabb eleme a higiénés intézkedések betartása (kézmosás, az élelmiszerek megfelelő kezelése), de kiemelt jelentőségű a rotavírus-ellenes védőoltás is.