Egyszerű keresés   |   Összetett keresés   |   Böngészés   |   Kosár   |   Súgó  


Részletek

A cikk állandó MOB linkje:
http://mob.gyemszi.hu/detailsperm.jsp?PERMID=125821
MOB:2017/4
Szerzők:Munkácsy Györgyi; Győrffy Balázs
Tárgyszavak:GÉNEXPRESSZIÓ-SZABÁLYOZÁS; ADATGYŰJTÉS; GYÓGYSZERES TERÁPIA
Folyóirat:Magyar Belorvosi Archívum - 2017. 70. évf. 2. sz.
[https://www.belgyogyasztarsasag.hu/folyoirat.aspx?web_id=&tmi=0&f=1&an=1932#j]


  Off-Target hatások számítása  / Munkácsy Györgyi, Győrffy Balázs
  Bibliogr.: p. 87. - Abstr. hun.,eng.
  In: Magyar Belorvosi Archivum. - ISSN 0133-5464. - 2017. 70. évf. 2. sz., p. 84-87. : ill.


Az RNS-interferenciával történő gén csendesítést, gyógyszeres kezelést és gének felülexpresszióját okozó vizsgálatokat úgy tervezzük, hogy egy adott génen érjünk el expressziós változást. Mint a legtöbb biológiai folyamat azonban, ezek a kezelések nem csak célspecifikus, hanem ún. off-target (más néven mellék-) hatásokat is eredményeznek. A vizsgálat célja egy olyan adatbázis felépítése, amellyel megmondható, hogy egy adott gén expressziójára mely kezelések fognak hatni. Az NCBI GEO adatbázisból kigyűjtötték azokat a 2005-2015 közötti Affymetrix HGU133A, HGU133plus2, HGU133Av2 platformon végzett vizsgálatokat, amelyekben géncsendesítést, gyógyszeres kezelést vagy génbevitelt követően vizsgálták a sejtvonalak génexpressziós mintázatát. A kontroll-kezelt párok összehasonlítását Wilcoxon-teszttel végezték. Az alkalmazás bemutatására keresést végeztek olyan kezelésekre, amelyek egyébként ismert off-target hatások kialakulását eredményezik Ennek során azonosították a tumorprogresszióban szerepet játszó MKI67, HIFIA és ABCB1 gének expresszióváltozását okozó kezeléseket A szerzők létrehoztak egy olyan adatbázist, amellyel azonosíthatók a vizsgálat központjában lévő gén(ek) expresszióváltozását okozó kezelések. Ezáltal az eddigieknél szélesebb paletta nyílik meg a megbetegedésekkel összefüggő jelátviteli folyamatok kulcsgénjeinek azonosítására és befolyásolására.