Az akut pancreatitis kezelése alapvetően nem sebészi, azonban a betegség súlyos formáiban gyakran kell valamilyen műtétet végezni. A fertőzött hasnyálmirigy-elhalás miatti műtétet lehetőleg a betegség kezdetétől számított 4-6. hétre érdemes tervezni, amikor már a beteg állapota stabilizálódott és kialakult az ún. demarkált nekrózis. Ilyenkor a minimál invazív módszerek mellett a sebészi kezelésnek van nagy jelentősége. A nyitott necrectomia és a műtét utáni öblítő kezelés, vagy a transgastricus necrectomia javasolt. A betegség korai stádiumában kialakuló konzervatív kezelésre nem javuló abdominalis kompartment szindróma esetén sürgős műtétet kell végezni. A dekompressziós laparotomia és a nyitott-has kezelés leghatékonyabb módszere a negatív nyomású sebkezelés. Vérzés, gyomor-bél perforáció és hashártyagyulladás esetén sürgős műtét javasolt. Biliaris pancreatitis esetén a programozott, vagy egyéb műtét során a cholecystectomia elvégzendő.