A területen szerzett pneumoniák hátterében egyre gyakoribbak az atípusos patogének (Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Legionella pneumophila). A megbetegedések 30-40%-át okozzák, a Streptococcus pnaeumoniae után a bakteriális tüdőgyulladások második leggyakoribb kórokozói. Az általuk okozott megbetegedések eltérnek a klasszikus bakteriális pneumoniától, más antibiotikumokra reagálnak, és hosszabb kezelést igényelnek (10-21 nap).