A megfelelő tisztítás elsőrendű fontosságú az orvosi eszközök előkészítése során. Egyrészt, a tisztítást követően is maradhat az eszközökön lerakódott szerves anyag. Másrészt, az eszközök manuális előkésztítésekor, munkavédelmi okokból, már az első lépésben a fertőtlenítésnek is meg kell történnie. Vizsgálatainkban, pere-cetsav bázisú fertőtlenítőszer és aldehid alapú fertőtlenítőszerek hatékonyságát hasonlítottuk össze a szerves anyagmaradékok eltávolítására. A perecetsav alapú szerrel, pH-függő módon, jelentősen jobb eredményt értünk el az alvadt vér eltávolításánál, mint aldehid alapú hatóanyag alkalmazásával. Az endoszkóp csövek belsejében található lerakódást, amely aldehiddel történő előkészítést követően megmaradt, perecetsavas fertőtlenítőszerrel végzett ismételt kezelés eltávolította. Ezek a megfigyelések egyezést mutatnak más szerzők eredményeivel, akik a perecetsav fölényét írták le aldehidbázisú szerekkel szemben a szerves maradékok eltávolítására.