Az Eisenmenger-szindróma a sönthöz köthető pulmonális artériás hipertónia legsúlyosabb formája. A betegség kihat az életminőségre, a betegek morbiditása, illetve mortalitása nagy. A pulmonális hipertónia célzott kezelésén kívül a prevenció, valamint a cianózis és a magas pulmonális nyomás szövődményeinek kivédésére tett lépések is fontos szerepet játszanak a jó általános állapot fenntartásában, a túlélésben. A tüdő- vagy szív-tüdő transzplantáció lehetősége az esetek többségében mérlegelendő.