A savfüggő emésztőrendszeri betegségek kezeléséhez, a megfelelő hatóanyag megválasztásához szükséges a gyógyszerek hatékonyságának és tolerálhatóságának ismerete. Refluxbetegségben (gastroesophageal reflux disease, GERD) és peptikus fekélybetegségben (peptic ulcer disease, PUD) szenvedők körében lefolytatott klinikai vizsgálatokban a rabeprazolt hatékonynak találták, és kedvező volt haszon-kockázat aránya is. Összehasonlító vizsgálatokban a rabeprazol legalább olyan hatékonynak bizonyult a GERD és a PUD kezelésében, mint az omeprazol, és hatékonyabb volt, mint a H2-blokkolók. A rabeprazol előnyeként e melhető ki napi egyszeri adagolása és a citokróm p450 rendszerben a további gyógyszerekkel adott alacsony interakció-potenciálja, mely idős betegek esetén kifejezetten fontos szempont. A rabeprazol további előnye a hatékony savgátlás, a magas gyógyulási arány, a tünetek gyors enyhülése és a kényelmes adagolás.