A Toll-like receptorok olyan specifikus motívumokat ismernek fel, amelyek gyakran megtalálhatók a baktériumokban, a gombákban, az egysejtűekben és a vírusokban. A Toll-like receptor 9-et olyan bakteriális és vírusos DNS, immunglobulin-DNS immunokomplexek és szintetikus oligodeoxinukleotid szekvenciák aktiválhatják, amelyek metilálatlan citozin-guanin dinukleotid (CpG) szekvenciákat tartalmaznak. A CpG-t tartalmazó DNS-ek három osztályra oszthatók aszerint, hogy milyen mértékben befolyásolják az antigén-specifikus humorális és celluláris immunitást és milyen mértékben termelnek I. osztályú interferonokat és proinflammatoricus (interleukin 6, interleukin 10) citokineket. A Toll-like receptor 9 aktiválása új terápiás célpontot jelenthet a daganatellenes terápiában és különböző gyulladásos betegségekben. Daganetellenes terápiában való használata rendkívül sokrétű, magába foglalja a vastagbél-, a hasnyálmirigy-, az ösztrogénpozitív emlő-, az androgénrezisztens prosztata-, a nagysejtes tüdőrákokat, valamint különböző lymphomákat és a melanomát. Új típusú terápiás lehetőséget jelenthet adjuvánsként való használatuk hepatitis B- és C-vírus-fertőzésekben is. A Toll-like receptor 9 antagonisták terápiás alkalmazását vizsgálják még szisztémás autoimmun betegségekben, DNS által közvetített szepszisben és más, krónikus gyulladásos folyamatokban is. Eddig tapasztalt mellékhatásprofiljuk kedvező: a lokális gyulladásos eltérések és a környező lymphaticus szövetek enyhe hyperplasiája jellemzi.