Az elmúlt évtizedben a molekuláris dokkolás alapvető módszerré vált olyan kutatási területeken (pl. virtuális szűrés, szerkezet alapú gyógyszertervezés), ahol a célkitűzés kis molekulák célfehérjén való kötődésének predikciója. A"DockingServer" egy olyan komplex webes megoldás, amely a molekuláris dokkolás összes lépését kezeli, kezdve a ligandum és fehérje előkészítésével egészen az eredmények bemutatásáig, integrálva számos, a számítógépes kémiában használatos szoftvert. A felhasználóbarát felület a biokémia minden területén tevékenykedő, még a molekuláris dokkolás területén tapasztalattal nem rendelkező kutató számára is lehetővé teszi a dokkolási számítások végrehajtását és az eredmények értékelését. Ugyanakkor a nagyobb tapasztalattal rendelkező felhasználók számára teljes szabadságot biztosít a ligandum és fehérje specifikus paramétereinek beállítására és a teljes dokkolási folyamat irányítására. Alkalmazható akár egy ligandum dokkolására és elemzésére, de ligandum könyvtárak célfehérjéhez való nagy áteresztőképességű dokkolására is. A "DockingServer" használatát paracetamol és CYP2E1 komplex képződésének példáján mutatjuk be.