A gyomorsav számos fiziológiás funkcióvál bír: fontos szerepe van a mikroorganizmusok elleni védekezésben, a fehérjék lebontásában, a vas, a kalcium és a 812 vitamin, valamint sok gyógyszer optimális felszívódásában. Ebből adódóan a tartós és erőteljes gyomorsavcsökkentés hosszú távon kalcium felszívódási zavarra (csontritkulásra), anaemiára, kontaminált vékonybél-szindrómára, Clostridium difficile fertőzésre vagy akár spontán bakteriális peritonitisre hajlamosíthat. Bár a gastro-oesophagealis refluxbetegség (GERD) alapvetően nem - vagy nem feltétlenül - jár hiperaciditással, a gyomorsav mégis központi szerepet játszik a patogenezisében, így a kezelés egyik fő pillére a savcsökkentés.