A mindennapokban az egyéb fertőzések, mint például a Clostridium difficile, vagy a vancomycin rezisztens Enterococcus fertőzések folyamatos kihívást jelentenek. A szájüregi fertőzést követően a kórokozók áthaladnak a gyomor-bél traktuson keresztül, ahol kolonizálódnak, túlélnek, szaporodnak és elindítják az inváziós folyamatot. A bél lumenében a gazdaszervezet mikrobiomja döntő szerepet játszik az invazív ágensek szaporodásának gátlásában. Sokszor tapasztaljuk azonban, hogy a jól adagolt antibiotikum terápia elenére a fertőzések recidiválnak, a beteg állapota érdemben nem javul.