A probiotikumok megfelelő mennyiségben történő fogyasztása esetén jótékony hatást gyakorolnak az egészségre, megőrzik, illetve visszaállítják a bélflóra integritását, ezáltal erősítik a barrier-mechanizmusokat, hozzájárulnak az immunrendszer megfelelő működéséhez. Komplex hatásmechanizmusuknak köszönhetően a tápcsatornát meghaladóan, számos egyéb területen alkalmazhatók sikeresen és biztonságosan. A probiotikus gyógyszerkészítmények alkotói a gyomorban uralkodó savas környezetet nagy számban élik túl, így képesek az intesztinális nyálkahártya kolonizációjára, a diszbiózis megszüntetésére. Prebiotikumokkal (bakteriális tápanyagok) együtt adagolva hatásosságuk fokozható.