Antibiotikumokat az orvosok leggyakrabban légúti fertőzésekben rendelnek. A felső légúti fertőzések döntő többségét vírusfertőzések okozzák, ennek ellenére számos beteg részesül antibakteriális kezelésben. Az alapellátásban ritkán nyílik mód mikrobiológiai vizsgálatra, de a légúti fertőzések etiológiája gyakran a kórházba kerülő betegeknél sem tisztázódik. Hasonló a helyzet az alapellátásban a húgyúti, valamint a bőr- és lágyrészfertőzések esetében. Az antibiotikumválasztásnál figyelembe kell venni a szóba jövő kórokozókat és azok antibiotikumérzékenységét. A Streptococcus pyogenes penicillinérzékenysége nem változott, a makrolidrezisztencia viszont egyre gyakoribb jelenség. A Streptococcus pneumoniae-izolátumok csökkent penicillinérzékenységűek lehetnek, és megjelentek a légúti quinolonokkal szemben rezisztens törzsek is. A húgyúti fertőzésekben már az alapellátásban is számolni kell rezisztens kórokozókkal.