Világszerte a leggyakrabban felírt gyógyszerek közé tartoznak az anti­biotikumok. Az antibiotikumok megváltoztathatják a bélflóra egyensúlyát, ami számos tünethez vezethet, leggyakrabban hasmenéshez (anti­biotic associated diarrhoea, AAD). A leggyakrabban amoxicillin-klavulánsav, ampicillin és cefalosporinok adása kapcsán jelentkezik hasmenés, de lényegében bármelyik antibiotikum adásakor előfordulhat. Különösen gyakori olyan antibiotikumok alkalmazása esetén, amelyek, az anaerob baktériumokra is hatnak. Az AAD-esetek nagyobbik részében kórokozó nem mutatható ki, és ilyenkor a hasmenés létrejöttében elsősorban a normális bélflóra egyensúlyának a megbomlása játszik szerepet, ami csökkenti a patogénekkel szembeni kolonizációs rezisztenciát. A "kolonizációs rezisztencia" az életkorral is gyengül. A diszbiózis és a következményes hasmenés kialakulásában szerepet játszó rizikótényezőket az 1. ábra mutatja be.