A bélflórát alkotó dinamikusan változó baktériumközösség meghatározó szerepet játszik a bélfal barrierfunkciójának fenntartásában, a kórokozók elleni védekezésben, az egyes élettani folyamatokban és a gazdaszervezet mukozális immunrendszerének megfelelő működésében. Változások a bélflórában különféle kórállapotokhoz, úgymint hasmenéshez, fertőzésekhez, metabolikus szindrómához, sőt allergiához, intoleranciához vezethetnek. A normális flóra visszaállítása - probiotikumok, prebiotikumok, vagy szinbiotikumok által - kulcsszerepet játszik a szervezet egészségének megőrzésében.