A molekuláris genetikai módszerek exponenciális fejlődésének és humán mikrobiom projektnek köszönhetően váratlan és meglepő új eredményekkel találkozhatunk a jelenleg zajló kutatások eredményeként. A közelmúltban a Humán Mikrobiom Projekt Konzorcium számolt be a humán mikrobiom összetételéről és struktúrájáról. A humán mikrobiom hatással van a reprodukció minden aspektusára, a gametogenezistől, a fertilizáción át az embrió migrációjára, beágyazódására, a korai sikertelen terhességre és késői magzati veszteségre, intrauterin fertőzésre és koraszülésre többek között. A lactobacillusok protektív szerepet játszanak vírusokkal és baktériumokkal szemben. Az eddig sterilnek gondolt placenta gazdag mikrobiommal rendelkezik. Egyik testtájékunk, a száj mikrobiom összetétele hasonlít a placenta mikrobiom összetételére. Az anya reproduktív traktusának mikrobiom összetétele meghatározó hatással bír az újszülöttre per vias naturales szülés esetén és ettől eltér a sectio Caesarea esetén. A retrográd, csecsemő-anya közötti transzfer, az úgynevezett enteromammary transzfer, az újszülött/csecsemő gasztrointesztínuma (GI) és az anyai emlő útvonalat érinti. Mikor kezdődik a magzati gasztrointesztinális rendszer kolonizációja és a meconium tartalmaz-e baktériumokat? Létezik-e ideális mikrobiális környezet, mely támogatja az in vitro fertilizációt vagy az in vitro fejlődést? Sikeresebb lenne a petesejt lefagyasztása bizonyos mikrobiális ökoszisztéma jelenlétében? A bakteriális vaginózis a leggyakoribb mikrobiológiai eredetű szindróma a női reprodukció időtartama alatt. A domináns lactobacillus flóra eltolódik a polimikrobiális flóra irányába. Kialakulását befolyásolja a dohányzás. A bakteriális vaginózisban megnövekedett baktérium diverzitás összefüggésbe kerülhet más nőgyógyászati bakteriális, parazitás és vírusfertőzésekkel. Új módszer, a VaginArray került bevezetésre a bakteriális vaginózis diagnosztikában és kezelésben. A menopauza alatt és után a hüvelyszárazság és az epithelsejtek atrófiája figyelhető meg. A rectalis lactobacillusok a hüvely flórára is hatással lehetnek, pótolják a fiziológiás hüvely microbiotát. Újabb, alkalmazott klinikai kutatási stratégiák, tudományos együttműködések szükségesek a humán mikrobiom és a női nemi szervi karcinómák jobb megértésére.