Az ember bőrfelületén, bélrendszerében és minden, a külvilággal kapcsolatba kerülő testüregében hatalmas tömegben élnek mikroorganizmusok, számukat összesen 1074 nagyságrendűnek becsülik, ami tízszerese az emberi szervezet sejtszámának. A közelmúltig az emberen, illetve emberben élő mikrobióta - meghatározott helyen lévő mikroorganizmusok összessége - nehezen vizsgálhatónak és alig megismerhetőnek tűnt, mivel ezeknek a mikroorganizmusoknak a többsége nem vagy csak nehézségek árán tenyészthető.