A szem az allergének és irritáló anyagok egyik legfőbb célpontja. Az allergiás conjunctivitis lényege a kötőhártya hízósejtjeinek specifikus IgE által közvetített aktivációja. A 20-30 perc alatt kialakuló azonnali típusú allergiás reakciót néhány óra múlva egy késői fázis követi gyulladásos sejtek beáramlásával. A hízósejtekből felszabaduló cytokinek esetenként súlyos, nehezen kezelhető, elhúzódó conjunctivitist tarthatnak fenn, és a cornea is érintett lehet.