A táplálékallergiák tünetei több szervrendszerben jelentkezhetnek, ezért sokszor nehéz a diagnózis felállítása. Ez lehet az oka annak, hogy - bizonyos szempontból - aluldiagnosztizált a betegség. Másrészt olyan esetekben is feleslegesen diétáztatnak gyermekeket, (de sokszor felnőtteket is), amikor nem áll fenn a táplálékallergia. Egyes tüneteket, laborértékeket túlértékelnek, vagy tájékozatlanok a táplálékallergiák természetes lefolyásáról, illetve az étkezési megszorítások szakmai elveiről. Kizárólag a szigorú allergénmentes diéta teszi a valóban táplálékallergiás beteget tünetmentessé. A tüneti (gyógyszeres) terápia csak kiegészítés lehet - ha egyáltalán szükséges.