A gasztrointesztinális traktus a legnagyobb felszín amellyel a külvilággal érintkezünk, elsődleges feladata a táplálékok emésztése és felszívódása. Mindezek mellett igen fontos endokrin és immunológiai szerv. Ez utóbbi a gasztrointesztinális barrier része, amely az immunogén anyagokkal interakcióba lép. Ennek az eredménye lehet tolerancia, de kialakulhatnak kóros gyulladásos folyamatok is. Infekciók, és infekció nélküli gyulladásos folyamatok, úgymint allergiás reakciók, immunmediált és autoimmun gyulladásos bélbetegség, eozinofil gyulladások, gluténszenzitív enteropátia az eredmény.