A gasztroentrológiai megbetegedések esetében a táplálásterápia különös hangsúlyt kap, komoly kihívást jelent a beteg emésztőrendszer megfelelő táplálása. Ezen betegségek kezelésében meghatározó a károsodott szervek megkíméltségének fenntartása. A mesterséges táplálás szükségességét jelzi, hogy malnutríciós állapotokban a szerveken súlyos lokális károsodás lép fel, amely súlyos szövődményekhez, elhúzódó gyógyuláshoz, magasabb mortalitáshoz és nem utolsó sorban jelentős költségemelkedéshez vezet. A táplálásterápia nem önmagában "a" táplálást, hanem a legtöbb esetben célzott gyógymódot is jelent. Az utóbbi évtized kutatási eredményei alapján a táplálásterápiában lehetővé vált az immunmoduláció lehetőségeinek kiaknázása is. Specifikus tápanyagfarmakonok bejuttatásával a szervezet gyulladásos válaszrekciójának befolyásolása is lehetővé vált. A táplálásterápia indokolt esetekben a komplex gyógyítás fontos eleme, hasznossága nem kérdőjelezhető meg és nem helyettesíthető más terápiás eljárással.