Akut bakteriális cisztitisz gyanúja esetén, ha lehet, törekedni kell a mikrobiológiai vizsgálatok elvégzésére is. Empirikus antibiotikum-választásként a három napig adott fluorokinolonterápia mellett jó alternatívát nyújt a II. és elsősorban a III. generációs orális cephalosporinok öt napig tartó alkalmazása. A fosfomycin trometamol in vitro hatékonysága mellett elsősorban nemzetközi adatok állnak. A sulfamethoxazol/trimethoprim empirikus adását a helyi adatokra támaszkodva kell meghatározni. Az adekvát antibiotikum-terápia mellett is fontos a megfelelő szupportív kezelés, amelynek alapja a nagy mennyiségű folyadékbevitel.