A kapszulás endoszkópia megjelenése jelentős előrelépést hozott a vékonybélbetegségek diagnosztikájában, a módszerrel a teljes vékonybélrendszer fájdalommentes leképezése lehetséges. A miniatürizált, lenyelhető videokamera fényforrást, elemeket és rádiótranszmitter egységet tartalmaz. A kapszulás endoszkópia diagnosztikai értéke az ismeretlen eredetű gasztrointesztinális vérzésekben bizonyított. A módszer a nem szteroid gyulladásgátlók által okozott enteropathiák felderítésében, és az örökletes polyposis szindrómákban is hasznos információkat nyújt. Feltételezett Crohn-betegségben a hagyományos endoszkópos kivizsgálás után kapszulával gyakran bizonyítható a vékonybél érintettsége is. A kapszulás endoszkópia gyermekgyógyászati indikációit, továbbá a coeliákiában nyújtott lehetőségeit jelenleg még vizsgálják.