A korai hypersensitivitasi reakció, a késői csontvelő-depresszió az azathioprin gyakori mellékhatása, az interstitialis pneumonia azonban ritka szövődménye. A 40 éves férfi beteg kiterjedt colitis ulcerosa miatt 10 éve kap azathioprint (150 mg/nap). Az inaktív bélbetegség mellett lázas állapot, hurutos tünetek jelentek meg. Bakteriális, virális infekció kizárható volt. A mellkas-röntgenfelvétel és a CT-vizsgálat progrediáló tüdőfolyamatot igazolt. A tüdőbiopszia szövettani vizsgálata interstitialis gyulladást mutatott, lehetséges okaként az azathioprin alkalmazásának lehetősége merült fel. A kezelés felfüggesztése, szteroid adása és intenzív ellátás után a beteg állapota javult. 3 hónap múlva a colitis ulcerosa sulfasalazin- és methylprednisolonkezelés mellett aktiválódott, mely miatt ileoanalis pouch műtét történt, a beteg állapota rendeződött. Atípusos pneumonia esetén, opportunista fertőzés hiányában, azathioprin okozta pneumonitis lehet jelen, mely a kezelés felfüggesztése után megszűnhet.