A 2003-ban elindult eEgészség Program a Magyar Információs Társadalom Stratégia (MITS) részeként létrejött egészségügyi és szociális ágazati információs stratégia (MITSESZ) megvalósítása. Ennek megfelelően az eEgészség Program egy összetett, 2003-tól 2006-ig tartó, az egészségügyi ágazatot információ-technológiai eszközökkel és módszerekkel támogató fejlesztési program. A program megvalósításának feladatát és az ehhez szükséges forrásokat az Egészségügyi Stratégiai Kutató Intézetre (akkor még MEDINFO) bízták. Az ESKI a feladat végrehajtására nyílt pályázatban kiválasztott szakértőkből hozta létre a bonyolításért felelős eEgészség Programirodát (www.e-egeszseg.hu), melynek feladata a pályázatok kiírása, a projektek végrehajtásának irányítása, felügyelete és értékelése, valamint a projektek koherenciájának biztosítása, a tapasztalatok összegzése és hasznosítása.