Súlyos otthon szerzett pneumonia miatt a pneumoniás betegek mintegy 1%-a kerül intenzív osztályra. A leggyakoribb kórokozók a Streptococcus pneumoniae, Legionella pneumophila, Gram-negatív baktériumok, köztük a Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus. Felkészült intézményben az esetek kb. 60-70%-ában születik mikrobiológiai diagnózis. A várható letalitás kórokozótól, életkortól, az empirikus terápia hatékonyságától, a rizikófaktorok meglététől függően 20-70% között mozog. A felvételtől számított 4 órán belül elindított adekvát terápia csökkenti a letalitást. Számos vizsgálat tanúsága szerint a kezdő empirikus terápiának hatékonynak kell lenni a Streptococcus pneumoniae, Legionella pneumophila és strukturális tüdőbetegség esetén a Pseudomonas aeruginosa ellen. Javasolható antibiotikumok a ceftriaxon vagy cefotaxim + azithromicin vagy chlarithromycin illetve moxifloxacin vagy levofloxacin. Pseudomonas gyanú esetén mindezek mellett (vagy más kombinációban) pneudomonas-ellenes béta-laktámnak is szerepelni kell a kombinációban (carbapenem+moxifloxacin, vagy levofloxacin vagy makrolid). A korai mikrobiológiai diagnózis segít az oki terápia meghatározásában illetve lehetővé teszi a kezdeti széles spektrumú empirikus terápia egyszerűsítését.