Bár a fejlett világ országaiban a fertőzéses állapotok előfordulása az utóbbi évtizedekben csökkenő tendenciát mutat, az esendő csoportok, elsősorban az idősek, csecsemők és krónikus betegségben szenvedők körében továbbra is jelentős veszélyeztetettséget okoznak ezek a megbetegedések. Egyre több adat gyűlik össze arra vonatkozóan, hogy a fertőzések kialakulásában és így megelőzésében is nagy szerepe van a bélmikrobiomnak.