A tápcsatorna mikroflórájának életciklusa a születést követően kolonizálódó baktériumokkal indul, majd a gazdaszervezet életciklusának megfelelően dinamikusan változó, átalakuló, növekvő/csökkenő számú baktérium-, vírus- és gombafaj által alkotott szimbiózisként él tovább. A külvilággal érintkező testfelületek (bőr, szájüreg, légutak, urogenitális rendszer, tápcsatorna) flórája közül egyértelműen a tápcsatornai mikrobiom a legnépesebb: 100 trillió különböző mikroorganizmus alkotja, amelynek természetesen legnagyobb részét a több, mint 1000 féle baktériumtörzs alkotja.