A sürgősségi endodontiai esetekkel való találkozás során a megfelelő terápiás lépések megtételének érdekében a fogorvos első feladata a helyes klinikai diagnózis felállítása. A differenciáldiagnózis során el kell különíteni egymástól a fogbélből és a periapicalis térből eredő elváltozások tüneteit. Míg a pulpaszövet heveny gyulladásos folyamatainak meghatározásánál a klinikai tünetek megállapításán van a hangsúly, addig a periapicalis teret is érintő kóros elváltozásoknál a klinikai szimptómák mellett, a helyes diagnózis felállításához figyelembe kell venni a radiológiai vizsgálattal szerzett információkat is. Harmadik eshetőségként meg kell említeni az endoparodontális kórképeket, amelyekben a parodontium megbetegedése az endodontiai elváltozás következményeként vagy a pulpa károsodásának kiváltó okaként egyaránt szerepelhet, ennek megfelelően a helyes diagnózis megállapítása az előbbieknél nehezebb, és a kezelés is komplexebb lehet. A páciens panaszainak alapos kikérdezése és az elvégzett intraorális vizsgálatok alapján kapott iránydiagnózist a radiológiai diagnózissal kiegészítve juthatunk el a klinikai diagnózishoz, mely determinálja a kezelési tervet.