A gyulladásos bélbetegségek elsősorban a reproduktív korú betegeket érintik, ezért a terhességgel kapcsolatos kérdések kiemelt jelentőséguek. A diagnózis felállításakor valamint a gondozás során fontos ezen kérdések tisztázása, a félelmek eloszlatása a helyes döntések elősegítés érdekében. A terhesség során a beteg kezelése a nőgyógyász, a gasztroenterológus és a háziorvos közös feladata. A felmerülő kérdéseket a beteggel és családjával meg kell beszélni és minden alkalommal kötelező az anya döntéseinek tiszteletben tartása. Fogamzás előtt fontos a remisszió elérése, és a terhesség során a stabil kezelés folytatása a remisszió fenntartása érdekében a megfelelő táplálás biztosításával. A dohányzás és alkoholfogyasztás ellenjavallt. Az IBD-ben alkalmazott gyógyszerek biztonságosnak tekinthetők a terhesség és a szoptatás során, a methotrexat, thalidomid és a szoptatás alatt a cyclosporin kivételével.