Az apolipoprotein B és az apolipoprotein A-I meghatározása nem múlja felül a hagyományos lipidméréseket, és nem alkalmazható a kardiovaszkuláris kockázat előrejelzésére (B szintű ajánlás, ellentmondásos eredménnyel zárult metaanalíziseken alapul). Az apolipoprotein B és a non-HDL-koleszterin kissé pontosabban jelzi előre a kardiovaszkuláris kockázatot, mint az LDL-koleszterin. Az apolipoprotein A-I emelkedett szintje a kardiovaszkuláris események előfordulásának kisebb valószínűségét vetíti előre (kivéve a stroke-ot), de kevésbé pontosan, mint a magas HDL-koleszterin.