A biszfoszfonátok valamelyest növelik a combcsont atípusos szártöréseinek kockázatát, ami a használat tartamával egyre nő (B szintű ajánlás, eset-kontroll és kohorszvizsgálatokon alapul). Szintén kismértékben növelik az állkapocs oszteonekrózisának kockázatát; ez gyakoribb az idősebbek és a nők között, illetve szájhigiénés problémák vagy daganatos betegség mellett (B szintű ajánlás, rendszerezett áttekintéseken alapul). Az alendronát és a risedronát csont- és ízületi fájdalmat okozhat (C szintű ajánlás, esettanulmányokon alapul). A combcsont szártörése vagy az állkapocs oszteonekrózisa esetén meg kell szakítani a biszfoszfonátkezelést, és a kis törési kockázatú betegek esetében 3-5 éves terápia után meg kell fontolni a kezelés abbahagyását (C szintű ajánlás, szakértői véleményen alapul).