Az egyes mikróbák kórokozó szerepének megítélése, előfordulási gyakorisága, nosocomialis jelentősége változik, melyek követése egy intenzív osztály működésének alapját képezi. Az antibiotikum-választás minden esetben tudatos kell legyen. A választásnál figyelembe kell venni, az infekció helyét, a várható kórokozót, a beteg állapotát, alap- és társbetegségeit, a megelőző antibiotikum-használatot és ismerni kell az osztályra jellemző baktériumflórát és ezek rezisztencia viszonyait. Csak rendszeres mikrobiológiai adatok alapján követhetjük az osztály szokásos baktériumflórájának megváltozását, egyes antibiotikumokkal szembeni rezisztens törzsek megjelenését és multirezisztens baktérium kiszelektálódását. Megfelelő intézkedésekkel a nosocomalis fertőzések aránya 30%-kal csökkenthető. A szakmai kollégiumok ajánlásaira támaszkodva, az infekciókontroll adatai alapján minden intézménynek a helyi viszonyokhoz alkalmazkodva kell antibiotikum protokollt összeállítani. Ehhez ismerni kell a nosocomialis fertőzésekre vonatkozó legfrissebb surveillance adatokat. Az infekciókontroll és az ehhez kapcsolódó surveillance adatai érzékenyen jelzik a megelőző munka hatékonyságát.