A felnőttkori endoszkópiával ellentétben a gyermekkorban végzett endoszkópiák meghatározó tényezője a kisebb méret miatti vékonyabb eszközök igénye. A másik döntő különbség, hogy gyermekkorban egy adott panasz hátterében más kórképek dominálnak mint felnőttekben, valamint eltérő az előkészítés menete és a szedáció is. Ebben a közleményben döntően a felső- és az alsó endoszkópiás vizsgálatokról lesz szó. Terjedelemi korlátok miatt a kapszula endoszkópia és egyéb ritka, hazánkban alig használatos speciális sajátosságok részletesebb ismertetése nem lehetséges.